这一季的故事承接第一季的剧情，哈哈和哈小龙再次留在了地球上。帮助兰兰完成上一季的宇宙探索梦想。同时，比邻星遭遇新的危机，人工智能系统因为太阳分子风暴的影响而毁坏，高度发展的比邻星β却因为失去最初的生产能力而陷入一片瘫痪。想要帮助比邻星回复原样，只能靠哈哈在地球上一步步继续探索，收集各种能量来帮助比邻星重建。
在地球上，哈哈探索了陶艺师、服装设计师、园艺师等等职业，也从物理，化学、生物、文学、美术等多个角度了解了地球人所需的职业技能和职业知识。而哈小龙，则是一直想要重现地球的恐龙时代，想尽办法捣乱，给哈哈和兰兰闹了不少笑话。兰兰和小伙伴也发现，世界能够正常运转，离不开各行各业辛勤的劳作和付出。每个职业，都有它的存在价值和社会职责，只有将每个工作做好，社会才能稳定发展，人类的历史才能有序发展。
对于两个外星人来说，哈哈急于修好太空船回到太空；公孙兰也想要帮助哈哈修好太空飞船进行一场拉风的太空之旅；呆萌的宠物哈小龙会不会记起他那破坏宇宙和平的野心呢？而他们最危险的敌人，则是公孙兰的对头，担任“来自未来号”宇宙科学兴趣小组组长的司马晴空。
而当飞船修好了，哈哈要回到自己的星球去了，公孙兰和小伙伴们才意识到，哈哈带给他们的，不只是外星科技，宇宙见闻，更多的是，对于职业的全新认知和知识的掌握。比邻星的重建也完成了，而哈哈又要面临着回去还是留下的历史性选择。兰兰的宇宙翱翔之梦能不能实现？哈小龙复辟恐龙帝国的野心能不能成功？哈哈到底是留在地球还是回到宇宙，回到比邻星继续执行他的星际任务，这些内容都将在这一季中得到解答。
